Preise und Medaillen
Ihrer Aufgabe, Wissenschaft und wissenschaftlichen Nachwuchs zu fördern, kommt die Akademie auch durch die Verleihung von Preisen nach. Jährlich vergibt sie für herausragende Leistungen in den Geisteswissenschaften den Max Weber-Preis, für solche in den Naturwissenschaften den Arnold Sommerfeld-Preis. Ebenfalls jährlich verleiht sie den Akademiepreis für nebenberuflich erbrachte wissenschaftliche Leistungen sowie den Akademie-Preis der Karl Thiemig-Stiftung für Nachwuchsförderung, alle zwei Jahre im Wechsel den Preis der Peregrinus-Stiftung für Publikationen jüngerer Geisteswissenschaftler, die dem Verständnis interdisziplinärer Zusammenhänge dienen bzw. gesellschaftspolitisch relevant sind, und den Robert Sauer-Preis für hervorragende Forschungsleistungen im mathematisch-naturwissenschaftlichen Bereich. Mit dem 2006 ins Leben gerufenen Friedrich Wilhelm Joseph von Schelling-Preis zeichnet sie Spitzenforscher aus. Persönlichkeiten, die sich besonders um die Akademie verdient gemacht haben, können mit der Medaille Bene merenti in Gold, Silber oder Bronze ausgezeichnet werden.
Von 2006 bis 2010 vergab sie den Rotary-Preis 'Hofgarten', von 2007 bis 2009 den Rotary-Preis 'Friedensengel'..
Alle Preise und Medaillen verleiht der Präsident während der Feierlichen Jahressitzung der Akademie, die traditionell Anfang Dezember stattfindet. Sie werden gemäß den jeweils geltenden Statuten auf Vorschlag vergeben. Eine Selbstbewerbung ist ausgeschlossen.
Seit 2003 verleiht die Akademie daneben die silberne Verdienstmedaille an Mitglieder, Mitarbeiter und ehemalige Mitarbeiter, die sich den Anliegen der Akademie in besonderer Weise verbunden gezeigt haben.
Gedenkmünze auf die Gründung der Bayerischen Akademie der Wissenschaften von Franz Andreas Schega. Sitzende Minerva mit Stab und Freiheitsmütze hält einen Schild mit dem Akademiewappen (Querraute, darauf das Motto "Tendit ad aequum"); rechts neben dem Würfel eine Eule. Die untere Inschrift lautet übersetzt: "Kurfürstlich Bayerische Akademie der Wissenschaften, gegründet in München am 28. März 1759, dem Geburtstag des Fürsten".