Die Abteilungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, in denen Forschungsvorhaben durchgeführt werden, heißen Kommissionen. Sie sind interdisziplinär aufgestellt und nach dem Prinzip der wissenschaftlichen Selbstverwaltung organisiert. Bearbeitet werden die Projekte von den wissenschaftlichen Mitarbeitern der Bayerischen Akademie der Wissenschaften. Die wissenschaftliche Leitung der Forschungsvorhaben liegt großteils bei den Mitgliedern der Bayerischen Akademie der Wissenschaften und teilweise bei Angehörigen anderer Forschungsinstitute bzw. Universitätsprofessoren, die ausgewiesene Spezialisten für das jeweils in der Kommission bearbeitete Themenfeld sind und deshalb zu Mitgliedern der Kommission gewählt wurden.
Die Kommissionen sind zwei Klassen zugeordnet: Der Philosophisch-historischen Klasse und der Mathematisch-naturwissenschaftlichen Klasse. Wie viele andere organisatorische Grundelemente geht die Unterteilung der Akademie in zwei Klassen auf die Gründungszeit zurück. Über die Navigation links können Sie sich in der Rubrik Forschung die in den Kommissionen durchgeführten Forschungsvorhaben nach Fachgebieten anzeigen lassen oder sich direkt über akademietypische Projekte informieren.
Außerdem gibt es auch klassenübergreifende Kommissionen und Arbeitsgruppen: im Unterschied zu den Kommissionen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften haben diese Arbeitsgruppen keine wissenschaftlichen Mitarbeiter. Sie sind im Bereich Forschung mit aufgeführt und dort jeweils nach Fachgebieten sortiert.