Der „Akademiepreis der Karl Thiemig Stiftung für Nachwuchsförderung“ wird seit 2010 an Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter verliehen, die sich durch besondere wissenschaftliche Leistungen bzw. überdurchschnittliches Engagement auszeichnen oder sich um die Förderung wissenschaftlicher Forschung an der Akademie verdient gemacht haben.
Vorschlagsberechtigt für den Preis sind alle Vorsitzenden der wissenschaftlichen Kommissionen, der Leiter des Leibniz-Rechenzentrums, der Leiter des Walther-Meißner-Instituts für Tieftemperaturforschung sowie der Präsident der Historischen Kommission bei der Bayerischen Akademie der Wissenschaften. Der Preis ist mit 3.000 Euro dotiert und wird aus Mitteln der Karl Thiemig-Stiftung zur Förderung von Kunst und Wissenschaft in Bayern finanziert.